Dankzij de overwinning in de eerste wedstrijd na de winterstop gaat Bayern nu met zes punten voorsprong op nummer twee RB Leipzig aan kop.
Leipzig komt zaterdag nog wel thuis in actie tegen Eintracht Frankfurt. Freiburg bezet de achtste plek op de ranglijst.
Janik Haberer opende al in de vierde minuut verrassend de score voor Freiburg. Tien minuten voor rust zorgde Lewandowski voor de gelijkmaker. Hij volleerde raak uit een voorzet van Douglas Costa.
Lewandowski
Lange tijd leek het duel op een gelijkspel af te stevenen, maar in de eerste minuut van de extra tijd bezorgde Lewandowski Bayern toch nog de zege.
De Poolse spits nam een voorzet van invaller Franck Ribery aan op zijn borst en schoot de bal met links binnen. Hij maakte zijn veertiende competitietreffer van het seizoen.
Robben speelde de hele wedstrijd mee bij Bayern, dat de zesde overwinning op rij boekte in de Bundesliga.